MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 1772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	TTAA	2	8	448	455	50 %	50 %	0 %	0 %	148243978
2	NC_009469	CG	3	6	494	499	0 %	0 %	50 %	50 %	148243978
3	NC_009469	CGG	2	6	547	552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243978
4	NC_009469	GGCT	2	8	650	657	0 %	25 %	50 %	25 %	148243978
5	NC_009469	GCG	2	6	720	725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243978
6	NC_009469	GCC	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243978
7	NC_009469	CGA	2	6	844	849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243978
8	NC_009469	CCT	2	6	885	890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243978
9	NC_009469	CCAC	2	8	932	939	25 %	0 %	0 %	75 %	148243978
10	NC_009469	AAC	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243978
11	NC_009469	C	6	6	964	969	0 %	0 %	0 %	100 %	148243978
12	NC_009469	CGT	3	9	983	991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243978
13	NC_009469	ATG	2	6	1036	1041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243978
14	NC_009469	CCAC	2	8	1389	1396	25 %	0 %	0 %	75 %	148243979
15	NC_009469	AAC	2	6	1406	1411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243979
16	NC_009469	CGT	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243979
17	NC_009469	AAT	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243979
18	NC_009469	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148243979
19	NC_009469	GTA	2	6	1549	1554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243979
20	NC_009469	TGT	2	6	1564	1569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243979
21	NC_009469	CCA	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243979
22	NC_009469	CAG	2	6	1627	1632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243979
23	NC_009469	GCG	2	6	1850	1855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243979
24	NC_009469	AAT	2	6	1913	1918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243979
25	NC_009469	GTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243979
26	NC_009469	CG	3	6	1998	2003	0 %	0 %	50 %	50 %	148243979
27	NC_009469	GGT	2	6	2034	2039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243979
28	NC_009469	CGC	2	6	2130	2135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243979
29	NC_009469	ATCT	2	8	2143	2150	25 %	50 %	0 %	25 %	148243979
30	NC_009469	ATC	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243979
31	NC_009469	TTG	2	6	2246	2251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243979
32	NC_009469	AAC	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243979
33	NC_009469	TGAA	2	8	2360	2367	50 %	25 %	25 %	0 %	148243979
34	NC_009469	CAC	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243979
35	NC_009469	TGC	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243979
36	NC_009469	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243979
37	NC_009469	CGT	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243979
38	NC_009469	TCC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243979
39	NC_009469	GCC	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243980
40	NC_009469	GGC	2	6	2774	2779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243980
41	NC_009469	GC	3	6	2877	2882	0 %	0 %	50 %	50 %	148243980
42	NC_009469	ACG	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243980
43	NC_009469	GCC	2	6	2961	2966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243980
44	NC_009469	TCG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243980
45	NC_009469	CAT	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243980
46	NC_009469	CAG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243980
47	NC_009469	CGC	2	6	3220	3225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243980
48	NC_009469	CGCC	2	8	3296	3303	0 %	0 %	25 %	75 %	148243980
49	NC_009469	CTA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243980
50	NC_009469	GC	3	6	3350	3355	0 %	0 %	50 %	50 %	148243980
51	NC_009469	GTT	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148243981
52	NC_009469	CCGA	2	8	3659	3666	25 %	0 %	25 %	50 %	148243981
53	NC_009469	TGG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243981
54	NC_009469	GCT	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243981
55	NC_009469	AG	3	6	3827	3832	50 %	0 %	50 %	0 %	148243981
56	NC_009469	GCC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243981
57	NC_009469	CGG	2	6	3950	3955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243981
58	NC_009469	GCG	2	6	3973	3978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243981
59	NC_009469	GAA	2	6	4040	4045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243981
60	NC_009469	CGGTG	2	10	4147	4156	0 %	20 %	60 %	20 %	148243981
61	NC_009469	CGG	2	6	4187	4192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243982
62	NC_009469	TGC	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
63	NC_009469	AC	3	6	4311	4316	50 %	0 %	0 %	50 %	148243982
64	NC_009469	TCG	2	6	4355	4360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
65	NC_009469	GC	3	6	4404	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
66	NC_009469	GAT	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243982
67	NC_009469	GCT	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
68	NC_009469	GCG	2	6	4430	4435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243982
69	NC_009469	CGC	2	6	4483	4488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243982
70	NC_009469	ACG	2	6	4500	4505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243982
71	NC_009469	GGC	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243982
72	NC_009469	GAA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243982
73	NC_009469	CGT	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
74	NC_009469	CGAGGC	2	12	4644	4655	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	148243982
75	NC_009469	TGG	2	6	4682	4687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243982
76	NC_009469	GCT	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
77	NC_009469	TC	3	6	4701	4706	0 %	50 %	0 %	50 %	148243982
78	NC_009469	CCGG	2	8	4718	4725	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
79	NC_009469	GAG	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243982
80	NC_009469	CTC	2	6	4939	4944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243982
81	NC_009469	GGC	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243982
82	NC_009469	GCC	2	6	4988	4993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243982
83	NC_009469	CGT	2	6	5019	5024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
84	NC_009469	GC	3	6	5063	5068	0 %	0 %	50 %	50 %	148243982
85	NC_009469	TGC	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243982
86	NC_009469	AGG	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243982
87	NC_009469	CGA	2	6	5228	5233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243983
88	NC_009469	GGT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148243983
89	NC_009469	ATC	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243983
90	NC_009469	GAT	2	6	5393	5398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243983
91	NC_009469	CG	3	6	5400	5405	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
92	NC_009469	TGATC	2	10	5420	5429	20 %	40 %	20 %	20 %	148243983
93	NC_009469	GGCA	2	8	5467	5474	25 %	0 %	50 %	25 %	148243983
94	NC_009469	GGC	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243983
95	NC_009469	GCC	2	6	5638	5643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243983
96	NC_009469	GCT	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243983
97	NC_009469	CG	4	8	5675	5682	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
98	NC_009469	CTG	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243983
99	NC_009469	GAA	2	6	5823	5828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148243983
100	NC_009469	GCA	2	6	5844	5849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243983
101	NC_009469	AGG	2	6	5944	5949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148243983
102	NC_009469	GC	3	6	6011	6016	0 %	0 %	50 %	50 %	148243983
103	NC_009469	CGG	2	6	6167	6172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243984
104	NC_009469	ACATT	2	10	6179	6188	40 %	40 %	0 %	20 %	148243984
105	NC_009469	ACC	2	6	6197	6202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243984
106	NC_009469	AGC	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243984
107	NC_009469	ATG	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243984
108	NC_009469	GCCG	2	8	6278	6285	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
109	NC_009469	GCGAT	2	10	6316	6325	20 %	20 %	40 %	20 %	148243984
110	NC_009469	TGC	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243984
111	NC_009469	ATC	2	6	6396	6401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243984
112	NC_009469	CAG	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243984
113	NC_009469	CT	3	6	6412	6417	0 %	50 %	0 %	50 %	148243984
114	NC_009469	CTT	2	6	6435	6440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148243984
115	NC_009469	TC	3	6	6467	6472	0 %	50 %	0 %	50 %	148243984
116	NC_009469	CGC	2	6	6487	6492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243984
117	NC_009469	A	7	7	6508	6514	100 %	0 %	0 %	0 %	148243984
118	NC_009469	ACA	2	6	6534	6539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243984
119	NC_009469	ACA	2	6	6581	6586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148243984
120	NC_009469	CGG	2	6	6591	6596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243984
121	NC_009469	AAT	2	6	6648	6653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148243984
122	NC_009469	GTGC	2	8	6787	6794	0 %	25 %	50 %	25 %	148243984
123	NC_009469	CA	3	6	6796	6801	50 %	0 %	0 %	50 %	148243984
124	NC_009469	GATG	2	8	6818	6825	25 %	25 %	50 %	0 %	148243984
125	NC_009469	CAC	2	6	6847	6852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148243984
126	NC_009469	CGA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148243984
127	NC_009469	GC	3	6	7064	7069	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
128	NC_009469	CGG	2	6	7075	7080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243984
129	NC_009469	GCCG	2	8	7204	7211	0 %	0 %	50 %	50 %	148243984
130	NC_009469	TA	3	6	7492	7497	50 %	50 %	0 %	0 %	148243985
131	NC_009469	TGGG	2	8	7570	7577	0 %	25 %	75 %	0 %	148243985
132	NC_009469	TCA	2	6	7579	7584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148243985
133	NC_009469	GCAGTG	2	12	7632	7643	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	148243985
134	NC_009469	A	7	7	7710	7716	100 %	0 %	0 %	0 %	148243985
135	NC_009469	TGA	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148243985
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138	NC_009469	GCG	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243985
139	NC_009469	GCC	2	6	8067	8072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243985
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143	NC_009469	CTG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243985
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151	NC_009469	GCG	2	6	8592	8597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243986
152	NC_009469	CTC	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148243986
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155	NC_009469	AGCCA	2	10	8665	8674	40 %	0 %	20 %	40 %	148243986
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159	NC_009469	CG	3	6	8855	8860	0 %	0 %	50 %	50 %	148243986
160	NC_009469	T	7	7	8996	9002	0 %	100 %	0 %	0 %	148243986
161	NC_009469	TCG	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243987
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163	NC_009469	TGCT	2	8	9928	9935	0 %	50 %	25 %	25 %	148243987
164	NC_009469	CGC	2	6	10012	10017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148243987
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168	NC_009469	CGGCT	2	10	10665	10674	0 %	20 %	40 %	40 %	148243987
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170	NC_009469	GCAT	2	8	10730	10737	25 %	25 %	25 %	25 %	148243987
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259	NC_009469	GGAT	2	8	15525	15532	25 %	25 %	50 %	0 %	148243992
260	NC_009469	GC	4	8	15567	15574	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
261	NC_009469	GCG	2	6	15581	15586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243992
262	NC_009469	CGAC	2	8	15696	15703	25 %	0 %	25 %	50 %	148243992
263	NC_009469	CG	3	6	15734	15739	0 %	0 %	50 %	50 %	148243992
264	NC_009469	TCG	2	6	15789	15794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148243992
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394	NC_009469	CGG	2	6	22571	22576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148243995
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